MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium saccharobutylicum DSM 13864

Total Repeats: 34068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022571	GTT	2	6	33	38	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022571	ATA	2	6	51	56	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022571	TAA	2	6	58	63	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022571	A	6	6	62	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022571	T	7	7	68	74	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022571	TA	4	8	77	84	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022571	GGA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022571	TA	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022571	AAC	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022571	ATA	2	6	1531	1536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022571	TTAC	2	8	1548	1555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022571	CAA	2	6	1614	1619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022571	CTA	3	9	1631	1639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022571	TTA	2	6	1640	1645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022571	A	6	6	1650	1655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022571	TA	3	6	1656	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022571	AATA	2	8	1694	1701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022571	AGG	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022571	TTA	2	6	2831	2836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022571	ATAA	2	8	3071	3078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022571	TTATT	2	10	3086	3095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022571	T	6	6	3122	3127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022571	AGG	2	6	4214	4219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022571	TTA	2	6	4514	4519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022571	AGG	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022571	ATT	2	6	8967	8972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022571	ATT	2	6	9007	9012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022571	AGC	2	6	9023	9028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022571	TAT	2	6	9037	9042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022571	AAC	2	6	9061	9066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022571	ATA	3	9	9117	9125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022571	AT	3	6	9149	9154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022571	GAA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022571	TTTA	2	8	9194	9201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022571	AATAT	2	10	9209	9218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022571	AAAT	2	8	9219	9226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022571	AT	3	6	9225	9230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022571	A	6	6	9246	9251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022571	AAG	2	6	9258	9263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022571	AACA	2	8	9268	9275	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022571	TAAA	2	8	9285	9292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022571	A	6	6	9362	9367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022571	A	6	6	9387	9392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022571	AAC	2	6	9401	9406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022571	GAAA	2	8	9416	9423	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022571	ATA	2	6	9449	9454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022571	GGC	2	6	9545	9550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022571	CTT	2	6	9582	9587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022571	GCG	2	6	9601	9606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022571	CGA	2	6	9781	9786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022571	GCA	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022571	GCA	2	6	9895	9900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022571	CGC	2	6	9902	9907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_022571	GTGA	2	8	9908	9915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022571	AGG	2	6	9971	9976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022571	CAG	2	6	9998	10003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022571	TGC	2	6	10108	10113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022571	GAA	2	6	10190	10195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022571	GCC	2	6	10334	10339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_022571	AGC	2	6	10417	10422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022571	GAA	2	6	10452	10457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022571	GGT	2	6	10525	10530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022571	GTC	2	6	10539	10544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022571	TCGTG	2	10	10548	10557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022571	GGA	2	6	10651	10656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022571	ATC	2	6	10675	10680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022571	AC	3	6	10702	10707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022571	AG	3	6	10727	10732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022571	AC	3	6	10870	10875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022571	CCT	2	6	11013	11018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_022571	ATG	2	6	11043	11048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022571	TACT	2	8	11088	11095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_022571	TGTTC	2	10	11116	11125	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022571	TA	3	6	11181	11186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022571	ACA	2	6	11191	11196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022571	AT	3	6	11207	11212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022571	GGA	2	6	11472	11477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022571	AGAA	2	8	11480	11487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022571	TAG	2	6	11501	11506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022571	GCGA	2	8	11509	11516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022571	ACC	2	6	11707	11712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_022571	TAC	2	6	11726	11731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022571	TGA	2	6	11733	11738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022571	GGGAG	2	10	11783	11792	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022571	TG	4	8	11841	11848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022571	ATG	2	6	11849	11854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022571	GGA	2	6	12022	12027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022571	AGT	2	6	12149	12154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022571	TAAGT	2	10	12312	12321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022571	AGC	2	6	12368	12373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022571	ACC	2	6	12447	12452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_022571	CGT	2	6	12493	12498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022571	TAG	2	6	12560	12565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022571	TCT	2	6	12624	12629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022571	TTA	2	6	12711	12716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022571	AGGAT	2	10	12735	12744	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022571	AG	4	8	12880	12887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022571	AGT	2	6	12889	12894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022571	GAG	2	6	12924	12929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022571	GAA	2	6	12948	12953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022571	CGG	2	6	13173	13178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022571	GTT	2	6	13433	13438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022571	ACC	2	6	13444	13449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_022571	CCT	2	6	13532	13537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022571	GGT	2	6	13668	13673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022571	TCG	2	6	13783	13788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022571	CGT	2	6	13863	13868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022571	GAG	2	6	13912	13917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022571	GTT	2	6	13966	13971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022571	CTGA	2	8	14138	14145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022571	A	7	7	14231	14237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022571	TAAT	2	8	14253	14260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022571	ATA	2	6	14265	14270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022571	ATG	2	6	14288	14293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022571	TG	3	6	14370	14375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022571	TAA	2	6	14397	14402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022571	CCA	2	6	14477	14482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_022571	CCA	2	6	14554	14559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_022571	A	7	7	14559	14565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022571	T	7	7	14586	14592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022571	TA	3	6	14599	14604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022571	ATA	2	6	14631	14636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022571	AT	3	6	14642	14647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022571	ATT	2	6	15163	15168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022571	GAT	2	6	15182	15187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022571	GAAA	2	8	15230	15237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022571	AGG	2	6	15262	15267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022571	AGG	2	6	17195	17200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022571	T	6	6	17439	17444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022571	TA	4	8	17458	17465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022571	AGTTA	2	10	17485	17494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022571	ATT	2	6	17502	17507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022571	ATT	2	6	17517	17522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022571	T	6	6	17521	17526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022571	AT	4	8	17534	17541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022571	AT	3	6	17564	17569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022571	TGA	2	6	17596	17601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022571	TAA	2	6	17608	17613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022571	TAT	2	6	17614	17619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022571	AG	3	6	17627	17632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022571	AGT	2	6	17695	17700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022571	TA	3	6	17705	17710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022571	TTC	2	6	17771	17776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022571	GAA	2	6	17790	17795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022571	T	7	7	17802	17808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022571	AT	3	6	17817	17822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022571	TTTTA	2	10	17823	17832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022571	GGA	2	6	17833	17838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022571	TTA	2	6	19129	19134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022571	ATA	2	6	19142	19147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022571	TAA	2	6	19150	19155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022571	CTT	2	6	19205	19210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022571	TAA	2	6	19213	19218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022571	ATA	2	6	19222	19227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022571	AGA	2	6	19228	19233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022571	AT	3	6	19256	19261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022571	ATG	2	6	19319	19324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022571	TAA	2	6	19351	19356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022571	TTA	2	6	19367	19372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022571	AAT	2	6	19374	19379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022571	TTTA	2	8	19380	19387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022571	ATA	3	9	19399	19407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022571	TTGC	2	8	19409	19416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_022571	TAA	2	6	19419	19424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022571	GCGT	2	8	19486	19493	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
166	NC_022571	T	8	8	19533	19540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022571	TTA	2	6	19673	19678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022571	T	6	6	19684	19689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022571	TAT	2	6	19770	19775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022571	TTA	2	6	19802	19807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022571	A	6	6	19858	19863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022571	TA	4	8	19891	19898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022571	AT	4	8	19969	19976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022571	TTTAT	2	10	19980	19989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_022571	TTCAT	2	10	20025	20034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
177	NC_022571	A	7	7	20119	20125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022571	TAA	2	6	20155	20160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_022571	T	7	7	20419	20425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022571	TA	3	6	20440	20445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_022571	TAT	2	6	20452	20457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022571	AT	3	6	20456	20461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022571	AAT	2	6	20495	20500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022571	AT	3	6	20499	20504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022571	ATG	2	6	20522	20527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_022571	TA	3	6	20542	20547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_022571	AAG	2	6	20565	20570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_022571	AT	3	6	20596	20601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_022571	AT	3	6	20624	20629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_022571	AT	3	6	28402	28407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_022571	TAAA	2	8	35899	35906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_022571	GTT	2	6	35969	35974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_022571	ATACA	2	10	36003	36012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_022571	T	7	7	36015	36021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_022571	GTTATG	2	12	36034	36045	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_022571	TA	3	6	36046	36051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_022571	A	6	6	36055	36060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_022571	ATA	2	6	36069	36074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_022571	ATT	2	6	36085	36090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_022571	A	7	7	36099	36105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_022571	GTA	2	6	36106	36111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_022571	TAA	2	6	36151	36156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022571	TAAT	2	8	36192	36199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022571	ATT	2	6	37409	37414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_022571	TA	3	6	37423	37428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_022571	TAAA	2	8	37436	37443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_022571	TTA	2	6	37479	37484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022571	AT	5	10	38488	38497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_022571	A	6	6	38540	38545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_022571	ATT	2	6	38582	38587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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